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PCR

PCR

PCR實(shí)驗(yàn)介紹

實(shí)驗(yàn)步驟

1、 樣本總RNA提?。═rizol法)

1. 取適量待測(cè)樣本加入液氮后研磨粉碎;

2. 用1ml Trizol將研磨樣本轉(zhuǎn)移到取到1.5ml EP管中;

3. 向1.5ml EP管中加入500ul酚氯,仿振蕩混勻后,靜止5分鐘;

4. 4℃ 12000rpm離心10分鐘,小心吸取上清于一新的1.5ml EP管中;

5. 向分離出的上清中加入700ul異丙醇,充分混勻;

6. 4℃ 12000rpm離心10分鐘,小心棄上清;

7. 用75%乙醇洗滌沉淀一次,室溫晾干;

8. 50ul DEPC水溶解RNA沉淀;

9. 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。

2、總RNA質(zhì)量檢測(cè)

使用核酸濃度測(cè)定儀測(cè)定RNA濃度和純度,測(cè)量前先用溶解RNA用的DEPC水調(diào)零,操作方法如下:

1.  抬起樣品臂,把樣品加到檢測(cè)基座上;

2.  放下樣本臂,使用電腦上的軟件開始吸光值檢測(cè)。在上下兩個(gè)光纖之間會(huì)自動(dòng)拉出一個(gè)樣品柱,然后進(jìn)行檢測(cè);

3. 當(dāng)檢測(cè)完成后,抬起樣品臂,并用干凈的無塵紙把上下基座上的樣品擦拭干凈。

濃度測(cè)定

260nm處讀值為1表示40 ng RNA/μl。樣品RNA濃度計(jì)算公式為:A260 X 40 ng/μl。

純度檢測(cè)

RNA溶液的A260/A280的比值是一種RNA純度檢測(cè)方法,比值范圍1.8到2.1。即使比值超出這個(gè)范圍,RNA樣品也一樣可以用于一些普通實(shí)驗(yàn)中如Northern雜交,RT-PCR和RNA酶保護(hù)實(shí)驗(yàn)。

3、逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA

逆轉(zhuǎn)錄使用invitrogen的逆轉(zhuǎn)錄試劑盒superscript III

1. 反應(yīng)體系1建立:

RNA200ng(10uL)
Oligo-dT1uL

2. 混勻,離心。65℃,5分鐘,結(jié)束后置于冰上。

3. 反應(yīng)體系2建立:

反應(yīng)體系112uL
dNTP(10uM)1uL
0.1M DTT2uL
5X Buffer4uL
RT酶1uL

4. 混勻,離心。置于42℃,水浴60分鐘。

5. 取出后置于85℃,反應(yīng)10分鐘,滅活逆轉(zhuǎn)錄酶。

6. 反應(yīng)結(jié)束后將產(chǎn)物置于-20℃待用。

4、實(shí)時(shí)熒光定量檢測(cè)

1. Real time PCR反應(yīng)體系建立:

cDNA2uL
PCR mix10uL
primer F1uL
primer R1uL
ddH2O6uL

2. 體系混勻后,瞬離一下,置于熒光定量PCR儀上,按照以下條件反應(yīng):

3. Realtime PCR反應(yīng)條件


步驟溫度時(shí)間循環(huán)數(shù)
預(yù)變性95℃5 min1
變性95℃10 sec40
退火58℃20 sec
延伸72℃20 sec
熔解曲線95℃15 sec1
60℃60 sec
95℃15 sec


結(jié)果示例:

合作流程:









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