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腸道菌群?jiǎn)渭?xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

組學(xué)測(cè)序

腸道菌群?jiǎn)渭?xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

產(chǎn)品介紹

     高通量腸道菌群?jiǎn)渭?xì)菌轉(zhuǎn)錄組(VITA GutMicrobiome)可實(shí)現(xiàn)對(duì)每個(gè)樣本1000-20000個(gè)細(xì)菌的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行檢測(cè),并進(jìn)行mRNA研究,用于腸道微生物組的功能及表型異質(zhì)性等后續(xù)的深度分析。


產(chǎn)品特點(diǎn)

    微生物學(xué)很早就發(fā)現(xiàn)了細(xì)菌菌落的異質(zhì)性,此新技術(shù)無(wú)需分離培養(yǎng)、捕獲通量高,可用于新基因、新轉(zhuǎn)錄本的挖掘,可在菌株水平進(jìn)行。


研究方法

     對(duì)細(xì)菌進(jìn)行固定透化后,使用隨機(jī)引物與細(xì)菌內(nèi)的RNA結(jié)合,對(duì)全轉(zhuǎn)錄組的RNA分子進(jìn)行原位逆轉(zhuǎn)錄。通過(guò)末端轉(zhuǎn)移酶(TdT)將捕獲接頭添加到cDNA的3’末端。之后,基于單細(xì)胞平臺(tái)進(jìn)行高通量單細(xì)菌標(biāo)記。

分析內(nèi)容

     腸道菌群圖譜構(gòu)建、菌群的基因表達(dá)圖譜分析、菌種異質(zhì)性分析、腸道菌群-噬菌體轉(zhuǎn)錄活性關(guān)聯(lián)分析。

分析結(jié)果示例圖





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